Lê gia nhập Mekong Capital từ năm 2003 với vai trò Trợ lý Nghiên cứu trong bộ phận tư vấn đầu tư. Cô tham gia quá trình thẩm định đầu tư và giai đoạn tạo giá trị sau đầu tư cho ba khoản đầu tư của MEF – quỹ đầu tiên do Mekong Capital tư vấn. Lê là Trưởng nhóm Tư vấn đầu tư, chịu trách nhiệm thẩm định khoản đầu tư vào công ty Chế biến Gỗ Đức Thành và phụ trách chính trong giai đoạn tạo giá trị sau đầu tư cho Gỗ Đức Thành từ 2004 đến năm 2007. Trong giai đoạn này, ngoài vai trò Trưởng nhóm Tư vấn đầu tư, Lê là thành viên đầu tiên phụ trách triển khai hoạt động tuyển dụng nhân tài cho các công ty trong danh mục đầu tư. Hoạt động này trở thành một phần quan trọng cho giai đoạn tạo giá trị gia tăng sau đầu tư của các quỹ do Mekong Capital tư vấn.
Từ năm 2007 đến nay, sau hành trình chuyển hóa của công ty, Lê chuyển sang vai trò quản lý khối vận hành của Mekong Capital, bao gồm các bộ phận Quan hệ Nhà đầu tư, Truyền thông, Tài chính, Nhân tài & Văn hóa (gần đây được mở rộng bao gồm cả Tuyển dụng Nhân tài – chuyên tuyển dụng nhân sự cho Mekong Capital và các công ty trong danh mục đầu tư), đội Trợ lý Tổng Giám đốc, Hành chính Văn phòng và Công nghệ Thông tin.